Målsetningen med utstillingene ved Bergens Sjøfartsmuseum er å gi et representativt bilde av Norges, og spesielt Bergens, sjøfartshistorie fra de eldste tider til i dag. Utstillingene består av en blanding av gjenstander, skipsmodeller, illustrasjoner, film og annet. I tillegg er det en målsetning at museet skal vise regelmessige skiftende utstillinger om aktuelle tema, i særlig grad knyttet til Bergens mangfoldige sjøfartshistorie. Besøkende skal både få et generelt overblikk over hvordan Bergen har utviklet seg som sjøfartsby, men også kunne fordype seg i spesialiserte tema.
Museet er i gang med en fornyingsprosess med de faste utstillingene. Følg med.